Laboratorium Genomiki i Analiz Epigenetycznych

Laboratorium Genomiki i Analiz Epigenetycznych (LGAE) UMB oferuje partnerom z sektora farmaceutycznego, biotechnologicznego, diagnostycznego i medtech dostęp do nowoczesnej infrastruktury sekwencjonowania nowej generacji oraz analiz multi-omicznych. Dysponujemy systemem platform sekwencjonowania Illumina, od Illumina NextSeq 500 do najwyższej przepustowości Illumina NovaSeq X plus (możliwość sekwencjonowania ponad 100 genomów człowieka jednocześnie).
Świadczymy kompleksowe usługi sekwencjonowania NGS, od ekstrakcji materiału biologicznego, przygotowania bibliotek i kontroli jakości, po wygenerowanie wystandaryzowanych danych sekwencyjnych zgodnie z procedurami SOP. Laboratorium spełnia najwyższe standardy dla laboratoriów genetycznych, w tym dysponuje śluzami powietrznymi oraz kontrolowanym przepływem powietrza zapobiegającym kontaminacjom. Posiadamy doświadczenie w opracowywaniu molekularnych testów diagnostycznych. Jesteśmy autorami patentu na diagnostyczny zestaw biomarkerów miRNA do diagnostyki raka jajnika, nagrodzonego m.in. Podlaską Marką 2024 w kategorii „Odkrycie" oraz zespołową nagrodą Ministra Zdrowia za wdrożenie technologii „omicznych" w ochronie zdrowia.
Oferta dla partnerów biznesowych obejmuje umowy usługowe na realizację sekwencjonowania i analiz molekularnych, wspólne projekty badawczo-rozwojowe (B+R), długoterminowe partnerstwa technologiczne oraz wsparcie merytoryczne w opracowywaniu i wdrażaniu molekularnych testów diagnostyczno-prognostycznych.
Ściśle współpracujemy z Laboratorium Obliczeniowej Medycyny Molekularnej (LOMM) UMB, oferując partnerom dostęp do pełnego ekosystemu kompetencji eksperymentalnych, analitycznych i wdrożeniowych. W ramach prowadzonych badań naukowych, B+R i usługowych współpracujemy także z Centrum Bioinformatyki i Analizy Danych oraz Centrum Medycyny Cyfrowej UMB.

Oferta badawcza:

• Sekwencjonowanie całogenomowe (WGS) i całoeksomowe (WES) – germinalne i somatyczne;

• Sekwencjonowanie transkryptomu (RNA-Seq) oraz mikrotranskryptomu (smallRNA-Seq – analiza ekspresji i edycji dojrzałych miRNA);

• Analizy metylomu DNA (RRBS – Reduced Representation Bisulfite Sequencing); 

• Analizy transkryptomowe pojedynczych komórek (scRNA-Seq);

• Analizy ekspresji mRNA i miRNA na platformie nCounter NanoString (m.in. liquid biopsy) 

• Walidacja molekularna biomarkerów technologią qPCR;

• Izolacja kwasów nukleinowych, przygotowanie bibliotek sekwencyjnych i kontrola jakości materiału biologicznego (DNA, RNA, miRNA) zgodnie z procedurami SOP.

Stosowane techniki badawcze:

Świadczymy szeroki zakres analiz NGS z wykorzystaniem najnowocześniejszych platform sekwencjonowania nowej generacji. Laboratorium wyposażone jest w system platform sekwencjonowania Illumina, w tym NovaSeq 6000, NovaSeq 6000 Dx oraz NovaSeq X Plus.
Specjalizujemy się szczególnie w następujących aplikacjach NGS:

• WGS (Whole Genome Sequencing)

• WES (Whole Exome Sequencing)

• RRBS (Reduced Representation Bisulfite Sequencing - metylom)

• RNA-Seq (transkryptom – ekspresja genów kodujących białka i lncRNA)

• smallRNA-Seq (mikrotranskryptom – ekspresja i edycje dojrzałych miRNA)

• scRNA-Seq (analizy transkryptomowe pojedynczych komórek)

Wykorzystujemy również platformę nCounter NanoString do analiz panelowych ekspresji mRNA i miRNA (m.in. w aplikacjach liquid biopsy) oraz technologię qPCR do walidacji molekularnej wybranych biomarkerów.

Infrastruktura laboratorium spełnia najwyższe standardy dla laboratoriów genetycznych, w tym posiada śluzy powietrzne oraz kontrolowany przepływ powietrza zapobiegający kontaminacjom. Wszystkie procesy laboratoryjne realizowane są zgodnie ze standardowymi procedurami operacyjnymi (SOP). Laboratorium osiąga najwyższe miejsca w corocznej certyfikacji jakości danych sekwencjonowania całoeksomowego prowadzonej przez Europejską Sieć Kontroli Jakości Badań Genetycznych (EMQN – European Molecular Genetics Quality Network) oraz agencję Oceny Jakości Genomicznej (GenQA – Genomic Quality Assessment).

Możliwe formy współpracy:

• współpraca naukowa z jednostkami akademickimi i instytutami badawczymi

• realizacja projektów badawczych we współpracy z partnerami przemysłowymi

• usługowa współpraca komercyjna

• wspólne projekty badawczo-rozwojowe (B+R)

• wspólne projekty naukowe

• współpraca w badaniach klinicznych z elementami translacyjnymi i zastosowaniem badań omicznych

• wspólne aplikowanie o projekty finansowane z funduszy zewnętrznych

• ekspertyzy naukowe i technologiczn

Odbiorcy oferty:

Wszelkie jednostki naukowe i badawcze, firmy biotechnologiczne i farmaceutyczne, laboratoria naukowe i diagnostyczne, szpitale i klinicyści, jednostki prowadzące badania kliniczne, instytucje zainteresowane wykonywaniem badań multi-omicznych oraz z obszaru genomiki.

Cennik badań / usług

Wycena współpracy przygotowywana jest indywidualnie po zapoznaniu się z potrzebami potencjalnego partnera naukowego lub komercyjnego.

Dane kontaktowe: