Tematy ćwiczeń z BIOLOGII MOLEKULARNEJ dla studentów II roku kierunku Farmacji

1. Podstawowe techniki uzyskiwania materiału do badań molekularno-genetycznych

Uzyskiwanie, transport i przechowywanie materiału biologicznego do izolacji kwasów nukleinowych

Podstawowe techniki izolacji kwasów nukleinowych (organiczna, adsorbcyjna, magnetyczna)

Ocena stężenia i czystości roztworów kwasów nukleinowych (spektrofotometryczna, fluorescencyjna, elektroforetyczna)

Elektroforeza kwasów nukleinowych

2. Amplifikacja kwasów nukleinowych

Zasady reakcji PCR

Projektowanie primerów i profilu termicznego reakcji PCR

Przygotowanie mieszaniny reakcyjnej do reakcji PCR

Analiza produktów PCR (elektroforetyczna)

Główne rodzaje reakcji PCR i ich zastosowanie (nested PCR, RT-PCR, multiplex PCR)

3. PCR w czasie  rzeczywistym

Zasady PCR w czasie rzeczywistym

Sposoby znakowania produktów PCR – za pomocą barwników fluirescencyjnych

Hybrydyzacja kwasów nukleinowych

Charakterystyka i projektowanie sond hybrydyzacyjnych

PCR w czasie rzeczywistym z sondami hybrydyzacyjnymi – zasady i zastosowanie (PCR ilościowy, detekcja mutacji punktowych)

Zastosowanie hybrydyzacji kwasów nukleinowych w analizach  (blotting, mikromacierzy)

4. Techniki molekularne analizy sekwencji kwasów nukleinowych

Sekwencjonowanie DNA techniką terminacji syntezy łańchucha

Pirosekwencjonowanie

Wykorzystanie mikromacierzy do sekwencjonowania DNA

Wysoceprzepustowe techniki sekwencjonowania DNA – sekwencjonowanie następnej generacji (NGS)

5. Zastosowanie bioinformatyki w badaniach molekularno-genetycznych

Zbiory bioinformatyczne danych molekularno-genetycznych

Wyszukiwanie informacji

Podstawowe narzędzia bioinformatyczne do analizy danych badań mikromacierzowych i NGS