Tematy ćwiczeń z BIOLOGII MOLEKULARNEJ dla studentów II roku kierunku Farmacji

• Podstawowe techniki uzyskiwania materiału do badań molekularno-genetycznych
  Uzyskiwanie, transport i przechowywanie materiału biologicznego do izolacji kwasów nukleinowych
  Podstawowe techniki izolacji kwasów nukleinowych (organiczna, adsorbcyjna, magnetyczna)
  Ocena stężenia i czystości roztworów kwasów nukleinowych (spektrofotometryczna, fluorescencyjna, elektroforetyczna)
  Elektroforeza kwasów nukleinowych
  Wykorzystanie urządzeń do automatycznej izolacji DNA i RNA

•  

• Amplifikacja kwasów nukleinowych
  Zasady reakcji PCR
  Projektowanie primerów i profilu termicznego reakcji PCR
  Przygotowanie mieszaniny reakcyjnej do reakcji PCR
  Analiza produktów PCR (elektroforetyczna)
  Główne rodzaje reakcji PCR i ich zastosowanie (nested PCR, RT-PCR, multiplex PCR)
  Klonowanie DNA – podstawowe etapy postępowania oraz analiza schematów eksperymentalnych
  Transformacja komórek – zasady metody i interpretacja wyników na podstawie danych przykładowych

•  

• PCR w czasie rzeczywistym
  Zasady PCR w czasie rzeczywistym
  Sposoby znakowania produktów PCR – za pomocą barwników fluorescencyjnych
  Hybrydyzacja kwasów nukleinowych
  Charakterystyka i projektowanie sond hybrydyzacyjnych
  PCR w czasie rzeczywistym z sondami hybrydyzacyjnymi – zasady i zastosowanie (PCR ilościowy, detekcja mutacji punktowych)
  Zastosowanie hybrydyzacji kwasów nukleinowych w analizach (blotting, mikromacierzy)
  Wykorzystanie ilościowego PCR w czasie rzeczywistym (Q-RT-PCR) do oceny ekspresji genów na poziomie RNA
  Analiza i interpretacja wyników oceny ekspresji genów
  Wyciszenie aktywności genów – podstawy teoretyczne i analiza danych przykładowych

•  

• Techniki molekularne analizy sekwencji kwasów nukleinowych
  Sekwencjonowanie DNA techniką terminacji syntezy łańcucha
  Pirosekwencjonowanie
  Wykorzystanie mikromacierzy do sekwencjonowania DNA
  Wysoceprzepustowe techniki sekwencjonowania DNA – sekwencjonowanie następnej generacji (NGS)
  Ocena sekwencji DNA z zastosowaniem technik wykrywania znanych mutacji i polimorfizmów genetycznych

•  

• Zastosowanie bioinformatyki w badaniach molekularno-genetycznych
  Zbiory bioinformatyczne danych molekularno-genetycznych
  Wyszukiwanie informacji
  Podstawowe narzędzia bioinformatyczne do analizy danych badań mikromacierzowych i NGS
  Analiza i interpretacja danych uzyskanych w badaniach genomu i transkryptomu
  Opracowywanie i przedstawianie wyników analiz molekularno-genetycznych z wykorzystaniem narzędzi informatycznych